Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2CP19387 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms