Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR2C1P13056 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms