Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms