Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.3 ms