Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNAJC28Q9NX36 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms