Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PCGF6Q9BYE7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCGF6Q9BYE7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms