Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms