Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SAMD8Q96LT4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SAMD8Q96LT4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SAMD8Q96LT4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAMD8Q96LT4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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