Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIX1LQ8IVB5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIX1LQ8IVB5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIX1LQ8IVB5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIX1LQ8IVB5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIX1LQ8IVB5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms