Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms