Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN1Q16658 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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