Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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