Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRADDQ15628 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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