Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCLAFQ15004 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCLAFQ15004 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms