Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IHHQ14623 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IHHQ14623 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IHHQ14623 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IHHQ14623 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IHHQ14623 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IHHQ14623 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IHHQ14623 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IHHQ14623 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IHHQ14623 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IHHQ14623 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IHHQ14623 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IHHQ14623 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IHHQ14623 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IHHQ14623 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IHHQ14623 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IHHQ14623 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IHHQ14623 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IHHQ14623 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IHHQ14623 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IHHQ14623 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IHHQ14623 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IHHQ14623 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IHHQ14623 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IHHQ14623 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IHHQ14623 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IHHQ14623 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IHHQ14623 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IHHQ14623 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IHHQ14623 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IHHQ14623 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IHHQ14623 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IHHQ14623 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IHHQ14623 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IHHQ14623 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IHHQ14623 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IHHQ14623 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IHHQ14623 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms