Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEUROD1Q13562 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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