Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMS2P3Q13401 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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PMS2P3Q13401 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PMS2P3Q13401 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PMS2P3Q13401 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PMS2P3Q13401 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PMS2P3Q13401 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PMS2P3Q13401 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
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