Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms