Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms