Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL20P78556 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL20P78556 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL20P78556 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL20P78556 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL20P78556 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL20P78556 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL20P78556 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL20P78556 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL20P78556 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL20P78556 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL20P78556 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL20P78556 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL20P78556 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL20P78556 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL20P78556 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL20P78556 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL20P78556 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL20P78556 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL20P78556 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCL20P78556 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL20P78556 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL20P78556 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL20P78556 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL20P78556 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL20P78556 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL20P78556 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL20P78556 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCL20P78556 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCL20P78556 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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CCL20P78556 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCL20P78556 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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