Protein–RNA interactions for Protein: P34981

TRHR, Thyrotropin-releasing hormone receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHRP34981 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRHRP34981 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRHRP34981 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRHRP34981 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRHRP34981 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRHRP34981 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRHRP34981 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRHRP34981 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRHRP34981 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TRHRP34981 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRHRP34981 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRHRP34981 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRHRP34981 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRHRP34981 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRHRP34981 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRHRP34981 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRHRP34981 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRHRP34981 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRHRP34981 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRHRP34981 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRHRP34981 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRHRP34981 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRHRP34981 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRHRP34981 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRHRP34981 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRHRP34981 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRHRP34981 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRHRP34981 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRHRP34981 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRHRP34981 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRHRP34981 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRHRP34981 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRHRP34981 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms