Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL3O95236 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL3O95236 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL3O95236 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL3O95236 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL3O95236 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL3O95236 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL3O95236 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL3O95236 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL3O95236 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL3O95236 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL3O95236 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL3O95236 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL3O95236 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL3O95236 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL3O95236 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL3O95236 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL3O95236 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL3O95236 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL3O95236 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL3O95236 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL3O95236 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL3O95236 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL3O95236 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL3O95236 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOL3O95236 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOL3O95236 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOL3O95236 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOL3O95236 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOL3O95236 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOL3O95236 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOL3O95236 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOL3O95236 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOL3O95236 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOL3O95236 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOL3O95236 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOL3O95236 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOL3O95236 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOL3O95236 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOL3O95236 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOL3O95236 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOL3O95236 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOL3O95236 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOL3O95236 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOL3O95236 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOL3O95236 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOL3O95236 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOL3O95236 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOL3O95236 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOL3O95236 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOL3O95236 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOL3O95236 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOL3O95236 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOL3O95236 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOL3O95236 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOL3O95236 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOL3O95236 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOL3O95236 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOL3O95236 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOL3O95236 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOL3O95236 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOL3O95236 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms