Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NLKQ9UBE8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NLKQ9UBE8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms