Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTV1Q96GA3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms