Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms