Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BEST4Q8NFU0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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