Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFNL1Q499Z3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFNL1Q499Z3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms