Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms