Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXNQ16595 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXNQ16595 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXNQ16595 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXNQ16595 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXNQ16595 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXNQ16595 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXNQ16595 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXNQ16595 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXNQ16595 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXNQ16595 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXNQ16595 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXNQ16595 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXNQ16595 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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FXNQ16595 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXNQ16595 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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FXNQ16595 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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FXNQ16595 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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FXNQ16595 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXNQ16595 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXNQ16595 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXNQ16595 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXNQ16595 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXNQ16595 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXNQ16595 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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