Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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BRD3Q15059 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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