Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM25Q14258 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM25Q14258 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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