Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOP3AQ13472 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms