Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX10Q12887 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX10Q12887 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX10Q12887 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX10Q12887 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX10Q12887 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX10Q12887 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX10Q12887 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COX10Q12887 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX10Q12887 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms