Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP214P35658 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP214P35658 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP214P35658 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP214P35658 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP214P35658 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP214P35658 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP214P35658 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP214P35658 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP214P35658 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP214P35658 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP214P35658 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP214P35658 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP214P35658 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP214P35658 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP214P35658 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP214P35658 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP214P35658 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP214P35658 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms