Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNA1P35221 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTNNA1P35221 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms