Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms