Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYBBP04839 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYBBP04839 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYBBP04839 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYBBP04839 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYBBP04839 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYBBP04839 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms