Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IFNB1P01574 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IFNB1P01574 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IFNB1P01574 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
IFNB1P01574 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNB1P01574 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNB1P01574 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNB1P01574 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNB1P01574 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNB1P01574 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNB1P01574 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNB1P01574 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNB1P01574 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNB1P01574 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNB1P01574 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNB1P01574 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNB1P01574 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNB1P01574 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNB1P01574 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNB1P01574 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNB1P01574 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNB1P01574 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNB1P01574 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNB1P01574 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNB1P01574 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNB1P01574 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNB1P01574 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IFNB1P01574 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms