Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SPAG9O60271 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPAG9O60271 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms