Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms