Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BARHL1Q9BZE3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms