Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPRY1Q96DX4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPRY1Q96DX4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPRY1Q96DX4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPRY1Q96DX4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPRY1Q96DX4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPRY1Q96DX4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPRY1Q96DX4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPRY1Q96DX4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPRY1Q96DX4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSPRY1Q96DX4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RSPRY1Q96DX4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RSPRY1Q96DX4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RSPRY1Q96DX4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPRY1Q96DX4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms