Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms