Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HACD2Q6Y1H2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms