Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHYHD1Q5SRE7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms