Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms