Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Q1T7F1 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
Q1T7F1 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
Q1T7F1 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
Q1T7F1 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
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