Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATP6V1FQ16864 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATP6V1FQ16864 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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