Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 SMARCB1-207ENST00000491967 605 ntTSL 1 (best)7.77□□□□□ -1.173e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LPIN1-202ENST00000396097 5690 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.173e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.173e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.173e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 TACC1-217ENST00000521866 1807 ntTSL 57.48□□□□□ -1.213e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 TACC1-205ENST00000518809 4116 ntTSL 1 (best)7.42□□□□□ -1.223e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 SORBS2-241ENST00000462661 4964 ntTSL 27.39□□□□□ -1.233e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 TACC1-206ENST00000519093 6447 ntTSL 1 (best)7.35□□□□□ -1.233e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 NPIPB11-201ENST00000524087 3653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.253e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 YARS-204ENST00000470377 782 ntTSL 37.17□□□□□ -1.263e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 SORBS2-246ENST00000469627 1575 ntTSL 1 (best)7.16□□□□□ -1.263e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 SORBS2-249ENST00000476878 595 ntTSL 36.94□□□□□ -1.33e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.313e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 MTA3-212ENST00000472767 768 ntTSL 26.78□□□□□ -1.323e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 SASH1-209ENST00000637469 523 ntTSL 46.25□□□□□ -1.414e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 SASH1-203ENST00000470750 617 ntTSL 35.79□□□□□ -1.484e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 PTPN4-203ENST00000430976 4154 ntTSL 55.47□□□□□ -1.533e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 SORBS2-256ENST00000488562 598 ntTSL 45.4□□□□□ -1.543e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 BCAS3-223ENST00000589916 546 ntTSL 25.3□□□□□ -1.563e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 USP25-209ENST00000547201 757 ntTSL 25.23□□□□□ -1.573e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 USP25-210ENST00000549362 606 ntTSL 24.96□□□□□ -1.623e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 MTA3-213ENST00000475383 624 ntTSL 34.89□□□□□ -1.633e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 PTPN4-206ENST00000441089 671 ntTSL 34.52□□□□□ -1.693e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.743e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 SRP54-204ENST00000553923 573 ntTSL 22.97□□□□□ -1.933e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 TACC1-215ENST00000521568 653 ntTSL 32.58□□□□□ -23e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 PKP4-205ENST00000426248 4134 ntTSL 1 (best)15□□□□□ -0.017e-7■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 SIN3A-206ENST00000565264 510 ntTSL 415.12■□□□□ 0.012e-10■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 SIN3A-208ENST00000567289 4078 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.582e-10■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 SIN3A-204ENST00000562776 590 ntTSL 410.3□□□□□ -0.762e-10■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 SIN3A-214ENST00000570115 554 ntTSL 410.11□□□□□ -0.792e-10■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 SIN3A-205ENST00000564778 617 ntTSL 29.57□□□□□ -0.882e-10■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 SIN3A-209ENST00000568190 567 ntTSL 47.95□□□□□ -1.142e-10■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 SIN3A-210ENST00000568309 549 ntTSL 47.58□□□□□ -1.22e-10■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 SIN3A-211ENST00000568431 565 ntTSL 56.93□□□□□ -1.32e-10■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 AGO2-203ENST00000518019 421 ntTSL 213.77□□□□□ -0.214e-7■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.563e-26■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 AXIN2-206ENST00000580513 1060 ntTSL 222.38■■□□□ 1.173e-10■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 AXIN2-204ENST00000577278 976 ntTSL 516.2■□□□□ 0.183e-10■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.521e-9■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 EPB41L2-204ENST00000392427 3369 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.351e-9■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 EPB41L2-205ENST00000445890 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.361e-9■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 EPB41L2-203ENST00000368128 4456 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.531e-9■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 EPB41L2-224ENST00000530481 3914 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.681e-9■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 EPB41L2-232ENST00000628542 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.781e-9■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 EPB41L2-201ENST00000337057 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.841e-9■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 EPB41L2-216ENST00000527411 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.851e-9■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 EPB41L2-221ENST00000529208 3023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -11e-9■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.491e-9■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 HDGF-204ENST00000465180 2060 ntTSL 1 (best)15.08■□□□□ 01e-7■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.441e-7■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 CDRT4-203ENST00000524205 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 29.87□□□□□ -0.832e-6■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.262e-8■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.262e-8■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 NACA-209ENST00000548084 542 ntTSL 311.72□□□□□ -0.532e-8■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 NACA-212ENST00000549259 690 ntTSL 510.86□□□□□ -0.672e-8■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 NACA-201ENST00000356769 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.72e-8■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 NACA-213ENST00000549855 711 ntTSL 59.36□□□□□ -0.912e-8■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 NACA-204ENST00000546392 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.052e-8■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 NACA-217ENST00000551520 544 ntTSL 28.32□□□□□ -1.082e-8■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 NACA-220ENST00000552055 521 ntTSL 57.9□□□□□ -1.142e-8■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 NACA-216ENST00000550952 2922 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.182e-8■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 NACA-218ENST00000551775 449 ntTSL 57.43□□□□□ -1.222e-8■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.252e-8■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 NACA-208ENST00000547914 543 ntTSL 57.22□□□□□ -1.252e-8■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 NACA-219ENST00000551793 768 ntTSL 26.04□□□□□ -1.442e-8■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 NACA-206ENST00000546862 492 ntTSL 34.24□□□□□ -1.732e-8■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.792e-8■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 SERINC3-203ENST00000411544 812 ntTSL 39.74□□□□□ -0.855e-17■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 ZMIZ2-208ENST00000463056 3240 ntTSL 213.97□□□□□ -0.176e-8■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 ZMIZ2-210ENST00000478045 3549 ntTSL 1 (best)13.69□□□□□ -0.226e-8■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.36e-8■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.346e-8■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 ZMIZ2-201ENST00000265346 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.656e-8■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 ZMIZ2-205ENST00000433667 3800 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.696e-8■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.932e-7■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 SH3PXD2A-204ENST00000420222 3251 ntTSL 214.46□□□□□ -0.098e-7■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.771e-6■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 HDAC2-207ENST00000520170 690 ntTSL 218.26■□□□□ 0.511e-6■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 HDAC2-209ENST00000520895 551 ntTSL 414.7□□□□□ -0.061e-6■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 HDAC2-217ENST00000524334 570 ntTSL 412.11□□□□□ -0.471e-6■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 HDAC2-211ENST00000521233 733 ntTSL 211.97□□□□□ -0.491e-6■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.661e-6■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 HDAC2-210ENST00000521163 557 ntTSL 59.46□□□□□ -0.91e-6■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 HDAC2-213ENST00000522371 502 ntTSL 44.36□□□□□ -1.711e-6■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 SYVN1-212ENST00000530451 656 ntTSL 517.73■□□□□ 0.433e-12■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 SEPT9-224ENST00000589246 594 ntTSL 214.74□□□□□ -0.052e-6■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 PTPRS-206ENST00000588552 5443 ntTSL 1 (best)15.05■□□□□ -04e-7■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 DGKK-201ENST00000611977 7407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.979e-7■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 PDXK-206ENST00000398085 796 ntTSL 320.22■□□□□ 0.831e-6■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 PDXK-218ENST00000498040 888 ntTSL 516.78■□□□□ 0.281e-6■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.231e-6■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.461e-6■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.325e-7■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 NEU4-213ENST00000435934 451 ntTSL 415.64■□□□□ 0.099e-7■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 ATP6V0A1-207ENST00000585828 2139 ntTSL 1 (best)15.38■□□□□ 0.051e-7■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.186e-8■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 MBOAT7-209ENST00000464098 493 ntTSL 213.67□□□□□ -0.222e-7■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 MBOAT7-208ENST00000453320 557 ntTSL 413.09□□□□□ -0.312e-7■■■■□ 22.1
PCBP2Q15366 GRAMD1A-210ENST00000599476 599 ntTSL 27.93□□□□□ -1.141e-7■■■■□ 22.1
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