Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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C1orf61Q13536 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf61Q13536 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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